måndag 15 juni 2020

SILOS -> Kunskapsdatabaser för släktforskning ett hjälpmedel för att matcha DNA segment med person

Vision: Att med ett klick kunna hitta möjliga kandidater för en DNA träff

Dagsläget släktforskning: Idag är det som borde vara svårast att hitta personer med samma DNA segment så enkelt medans det som borde vara enkelt om vi släktforskare gjorde rätt och inte skapade SILOS att hitta vilka personer som har något gemensamt som finns i en socken, kyrkbok, eller på samma grupp av foton är så svårt....

Lösningen: tydligt beskriva personer/ källor... med länkad data dvs. data som data 

Ny användning: kort prat med polisens Ricky Ansell,verksamhetsexpert hos NFC och projektledare för den forensiska delen i pilotprojektet där han driver projekt att se om släktforskning och DNA tester kan börja användas... se "Dna-baserad släktforskning kan bli nationellt använd metod" där sidan 2 "Steg 3. Träfflista och urval" är det som borde styras upp





Status idag 2021
  • DNA provtagningen 
    • är extremt bra uppstyrd där DNA provet översätts till segment och matchande segment --> enkelt skapa maskinläsbara lösningar
       
  • Släktforskning 
    • har idag ofta persistenta identifierare till plats i källor som Riksarkivet SVAR eller Arkiv Digital vilken sida/kyrkbok personer finns på 
      • tyvärr är det ofta dålig struktur på källor/händelser i släktträd medans relationen pappa/barn oftast enkelt kan exportera till standarder som GEDCOM  
    • stor fördel finns att persistenta identifierare finns i bra släktforskning exempel födelsebok Alfred Nobel har "Jakob och Johannes kyrkoarkiv, Födelse- och dopböcker, SE/SSA/0008/C I a/21 (1828-1844), bildid: C0054707_00124" jmf Wikidata Q23810#P19 
  •  Kyrkböcker och andra källor
    • har ofta inget bra API och tydlighet hur man kan skapa mått som fungerar med maskininlärning
      • hur många sidor det skiljer mellan 2 personer i en kyrkbok
      • hur långt det fysiska avståndet är mellan 2 böcker i tid eller plats
        • 2018 sep pratade jag på släktforskarmässan med Family search, Arkiv Digital och Riksarkivet att det fysiska avståndet har vi i Wikidata
          • File:Sign-check-icon.png T199907 Arkiv Digital satte upp ett möte veckan efteråt och skapade en arbetsyta --> finns sedan feb 2019 i produkten med stöd att navigera kyrkböcker från karta, fick > 1000 likes på FB
          • File:Sign-check-icon.png T200515 Family search återkom med person i USA så vi satte upp nya mallar så deras sidor om församlingar nu kan nå karta, kyrkböcker etc. 
            • pga snygg arkitektur med mallar och Wikidata var det 5 rader kod i en mall som fixade det....  
          • File:Stop hand.svg T200181 Riksarkivet har inte kommit tillbaka känns som man inte vidareutvecklar sin tjänst, gissar att bidragen ramlar in ;-)
>


Föredrag 2018-04-21 GF




Tanken är att
  • DNA träffar i en släktforsknings databas kan mha av en kunskapsgraf ringa in möjliga kandidater bättre om metadatat är länkade data 
     
  • En kunskapsdatabas
    • kan innehålla personers släktträd
    • vilka källor som används
    • vilka platser en person föddes , dog, levde
    • vilka bilder en person finns på
I Sverige har vi enormt bra kyrkböcker --> att finns en person i samma kyrkbok så ger det en ledttråd som kan vara en grovuppskattning av ett "släktavstånd"

Externa länkar

Citation Graphs

Ett område där man utnyttjar kunskapsgrafer är att dela upp vetenskapliga artiklar i vilka dom refererar och då kunna skapa grafer vilka artiklar som publicerats nya. Där identifierar man unikt


Exempel Scholia Ricky Ansell Q96248799 där visas vilka som varit medförfattare på de publikationer han skrivit och hur dom refererar andra

nedan exempel frågor författare och medförfattare



  • Video vad vi ser ovan youtube
     
  • vilka artiklar som publicerats inom ämnet "nucleic acid sequence analysis" och deras författare och hur dom har kopplingar mellan varandra

'
Min tro är att på samma sätt kan kunskapsgrafer hjälpa till att skapa samband mellan DNA och källor som citeras där vi ur källorna kommer att hitta samband som
  1. finns 2 personer med samma DNA segment som har några personer i deras släktträd som finns "nära" varandra i  kyrkböckerna --> en stark indikation att det kan vara där den genetiska kopplingen finns
     
  2. kunna gruppera DNA träffarna enligt olika parametrar och se samband som snabbare gör att vi kan ringa in personer av intresse,,,
     
  3. gör man samma sak ned kort så skapar det även möjlighet att skapa grafer som grupperar ihop personer 
Vad behövs?
  1. Börja identifiera personer källor unikt....

Länkar


Svenska Riksdagsdokument laddas nu upp till WIkidata --> vi kan klustra personer vilka som skriver motioner ihop fråga  









Frågor tankar om detta se Facebook gruppen Släktforskning Semantisk Web



Inga kommentarer:

Skicka en kommentar